变构蛋白质代谢相互作用的系统鉴定,体内控制酶的活性。
·链接,卡尔Kochanowski,Uwe Sauer
发表于23455438
摘要
最近的数据表明,大多数的蛋白质结合特定的代谢产物,这种相互作用是相关的代谢和基因调控。然而,有没有方法来系统地识别变构蛋白质代谢的相互作用。在这里,我们提出一个实验和计算方法使用动态代谢数据发现变构调节体内相关。通过切换的培养条件下大肠杆菌每30秒之间的介质含有14C-果糖或葡萄糖或丙酮酸或(13),我们测量逆转磁通通过糖酵解途径和观察到的快速变化的代谢物浓度。我们适应这些数据对糖酵解的动力学模型和系统测试126个变构相互作用对代谢动力学的影响。我们确定的变构作用支配糖异生、糖酵解之间的可逆开关,包括一个由丙酮酸激活果糖-1,6 -二磷酸酶。因此,从大的假定的变构相互作用,我们的方法可以确定最有可能的,提供有关其功能的假说。